الهدف من مدرسة النابغة الصغير هو تخريج جيل يكون متجذرا في العلوم و قادرا على التفاعل في محيطه الإجتماعي، مما يمنحه قدرة على التكيّف للعيش المشترك و ترسيخ قيم التسامح و التنوّع و الإحترام مؤسسة تعليمية يتعلم فيها التلاميذ الدروس بمختلف العلوم وتكون الدراسة بها عدة مراحل وهي التمهيدي والابتدائية والمتوسطة أو الإعدادية والثانوية التي تعمل على إعداد المتعلم ليكون شخصاً إيجابياً في المجتمع